Oltre 160.000 nuove specie di virus sono state scoperte da ricercatori cinesi e australiani utilizzando l’Intelligenza Artificiale.
Negli ultimi anni, i virus RNA hanno guadagnato attenzione per il loro ruolo cruciale negli ecosistemi globali. Tuttavia, nonostante la loro ubiquità, molti di questi virus rimangono non identificati a causa delle limitazioni degli strumenti metagenomici attuali. Questo articolo presenta un nuovo algoritmo di deep learning, chiamato LucaProt, progettato per scoprire sequenze altamente divergenti di virus RNA.
Un team di scienziati dell’Università di Sydney, dell’Apsara Lab di Alibaba Cloud Intelligence e della Sun Yat-sen University ha rivelato in uno studio pubblicato su Cell di aver utilizzato un nuovo strumento di apprendimento automatico per scoprire 161.979 nuove specie di virus dell’acido ribonucleico (RNA).
LucaProt integra informazioni sequenziali e strutturali per identificare sequenze di RNA dipendente da RNA polimerasi (RdRP) in 10.487 metatranscrittomi provenienti da diversi ecosistemi globali. Questo approccio ha rivelato 161.979 specie potenziali di virus RNA e 180 supergruppi di virus RNA, ampliando notevolmente la nostra comprensione della virosfera.
L’analisi ha dimostrato che LucaProt è in grado di identificare virus RNA precedentemente trascurati, inclusi gruppi con una diversità e abbondanza variabile tra gli ecosistemi. La metodologia ha confermato la presenza di virus in ambienti estremi come sorgenti calde e fondali marini.
Questo studio sottolinea l’importanza dell’uso dell’intelligenza artificiale nella scoperta di virus RNA e offre strumenti computazionali per migliorare la documentazione del viroma globale. L’approccio innovativo di LucaProt potrebbe portare a una maggiore comprensione della diversità virale e del loro impatto sugli ecosistemi.
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